Comme le dit Fabrice, idéalement il faut 3 fichiers. Le iPad, le Bureau et le Synchro. Le Bureau et le Synchro étant hébergés sur FM Server. L'avantage, c'est que ce fichier Synchro s'ouvre seulement quand on demande la synchro. Et dans votre cas, de l'iPad vers le Bureau. L'utilisateur iPad fait ses saisie sans connexion, puis "le soir" demande d'envoyer ses nouvelles données au "serveur". Un script sur la version iPad ouvre (se connecte) le fichier Synchro, qui éventuellement ne comporte aucune table; seulement des occurrences des 2 autres fichiers.
La synchro est un sujet complexe, même dans un seul sens. Relisez le doc de Claris, faites des tests à petite échelle sur 3 fichiers simples. Tester les erreurs lors d'une déconnexion pendant la synchro (dans ce cas elle ne doit pas être validée) etc etc.
Bon courage Ernest (heu Bard )